RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253099.10

MRPL4-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL4, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-201ENST00000253099 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 BTBD16Q32M84 506 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 PLAG1Q6DJT9 500 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 GALNT12Q8IXK2 581 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CRELD1Q96HD1 420 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 S100A3P33764 101 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SOX18P35713 384 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 GPR143P51810 404 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 RRADP55042 308 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MANFP55145 182 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 EXT1Q16394 746 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 FUNDC1Q8IVP5 155 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MORN4Q8NDC4 146 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ING2Q9H160 280 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SAR1AQ9NR31 198 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CCDC167Q9P0B6 97 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 KCNMB2Q9Y691 235 aa23.3■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 DYRK3O43781 588 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CD1EP15812 388 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MAP4K2Q12851 820 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 HSPB3Q12988 150 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 AGKQ53H12 422 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 NATD1Q8N6N6 113 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CLEC1AQ8NC01 280 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 KAT2AQ92830 837 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 NCLNQ969V3 563 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 FBXL20Q96IG2 436 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.29■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 A0A1W2PRB8 838 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 FAM234BA2RU67 622 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 PGRP06401 933 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ICAM2P13598 275 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ST3GAL2Q16842 350 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 M1APQ8TC57 530 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF675Q8TD23 568 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF721Q8TF20 911 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 NMUR2Q9GZQ4 415 aa23.28■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 SCN2BO60939 215 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 IGKV3-11P04433 115 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 IL6P05231 212 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 S1PR1P21453 382 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MLC1Q15049 377 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ANKRD46Q86W74 232 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZFP28Q8NHY6 868 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 OR52E6Q96RD3 313 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 NUDT9Q9BW91 350 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 MMP25Q9NPA2 562 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 DOCK10Q96BY6 2186 aa23.27■■□□□ 1.32
MRPL4-201ENST00000253099 ITPR1Q14643 2758 aa23.27■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 C6orf47O95873 294 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 SERPINA7P05543 415 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 SSTR4P31391 388 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 FUT7Q11130 342 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 RCAN2Q14206 197 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM107Q6UX40 140 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 CLECL1Q8IZS7 167 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 ELP5Q8TE02 316 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 OR5P2Q8WZ92 322 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 VPS33AQ96AX1 596 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 ART5Q96L15 291 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.26■■□□□ 1.31
MRPL4-201ENST00000253099 ANKRA2Q9H9E1 313 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms