RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R31P59538 309 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GALK2Q01415 458 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RDH14Q9HBH5 336 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.9□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.9□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 A8MU76 341 aa6.9□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 ANKRD28O15084 1053 aa6.9□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 VNN2O95498 520 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 IGHEP01854 428 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 THBS2P35442 1172 aa6.9□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ARMC5Q96C12 935 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.9□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR1A2Q9Y585 309 aa6.9□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 AGAP5A6NIR3 686 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 M0R233 179 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 HK3P52790 923 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PER3P56645 1201 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ACTBP60709 375 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ACTG1P63261 375 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 ARSKQ6UWY0 536 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TREML1Q86YW5 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KCNA7Q96RP8 456 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NELL2Q99435 816 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 GTF2F2P13984 249 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 ACY1Q03154 408 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 C14orf80Q86SX3 495 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR2T4Q8NH00 348 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 TMEM74Q96NL1 305 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CD93Q9NPY3 652 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 VILLO15195 856 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 HCRTR2O43614 444 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 XPNPEP2O43895 674 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 P04436 131 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 UBL4AP11441 157 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CREB1P16220 341 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF43P17038 809 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 AMY2BP19961 511 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KEAP1Q14145 624 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NR0B2Q15466 257 aa6.89□□□□□ -1.31
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