RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077853.4

Prpf4b-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4b, Length 7,844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plscr1Q9JJ00 328 aa8.4□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Alyref2Q9JJW6 218 aa8.4□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ilf3Q9Z1X4 898 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa8.4□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 CerklA2AQH1 525 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm16434J3QN10 205 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 4930555G01RikL7N253 205 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pdx1P52946 284 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bdkrb1Q61125 334 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pamr1Q8BU25 720 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 DrgxQ8BYH0 263 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 FgbQ8K0E8 481 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ogfrl1Q8VE52 464 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SelenosQ9BCZ4 190 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ccdc167Q9D162 97 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam3bQ9D309 235 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mllt6B1AR10 1109 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SelenonD3Z2R5 557 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Etv4P28322 485 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Id2P41136 134 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctbp2P56546 445 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Actr1aP61164 376 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pde12Q3TIU4 608 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Dcdc2Q5DU00 475 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Foxd3Q61060 465 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Doc2aQ7TNF0 405 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plekhs1Q8BW88 474 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sidt2Q8CIF6 832 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Actr1bQ8R5C5 376 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rab25Q9WTL2 213 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm19965J3QNY8 723 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Scarb2O35114 478 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bhlhe40O35185 411 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Socs5O54928 536 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pim1P06803 397 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lrrc3P59034 257 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Crtc2Q3U182 692 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SctrQ5FWI2 447 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr381Q5SSP0 311 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ppp5cQ60676 499 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Eif1aQ60872 144 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 P4ha3Q6W3F0 542 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pgm2Q7TSV4 620 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gpr62Q80UC6 358 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc15a3Q8BPX9 578 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lrrn3Q8CBC6 707 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cxxc1Q9CWW7 660 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tssk4Q9D411 328 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plag1Q9QYE0 499 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nfkb2Q9WTK5 899 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Loxl3Q9Z175 754 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr239A0PK55 315 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr640E9Q7P5 314 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rnpepl1G5E872 720 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr55K7N6Q1 315 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 GzmeP08884 248 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Taar7aQ5QD12 358 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vat1Q62465 406 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 ReltQ8BX43 436 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gpr1Q8K087 353 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gbgt1Q8VI38 347 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sapcd1Q9CY86 146 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Hcar2Q9EP66 360 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rgs17Q9QZB0 210 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pcsk2P21661 637 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Wnt6P22727 364 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Man2a1P27046 1150 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Stfa2P35174 103 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kcnj8P97794 424 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctu2Q3U308 514 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Apex2Q68G58 516 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm5346Q7M766 736 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc35f1Q8BGK5 408 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ostm1Q8BGT0 338 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem5Q8VDX6 444 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mtif3Q9CZD5 276 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam43bA2AM80 330 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vmn2r95L7N274 845 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adh5P28474 374 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Plk5Q4FZD7 595 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Thoc6Q5U4D9 341 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ptpn21Q62136 1176 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sall4Q8BX22 1067 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Amer2Q8CCJ4 672 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 C1raQ8CG16 707 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tram1l1Q8QZR0 363 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Q922R1 422 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Prdm9Q96EQ9 843 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Prss16Q9QXE5 509 aa8.39□□□□□ -1.07
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mon2Q80TL7 1715 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.4 ms