RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 CCDC192P0DO97 292 aa24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 CAMK4Q16566 473 aa24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.48■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 TPM3P06753 285 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 LIG1P18858 919 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 TTC6Q86TZ1 520 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
PMS1-222ENST00000639501 SSH3Q8TE77 659 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 TYRO3Q06418 890 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 NECAB1Q8N987 351 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 PTH1RQ03431 593 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 FERMT3Q86UX7 667 aa24.42■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 ME3Q16798 604 aa24.42■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K11Q16584 847 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CBX8Q9HC52 389 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 CNTROBQ8N137 903 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.41■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.4■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 FEZ1Q99689 392 aa24.39■■□□□ 1.5
PMS1-222ENST00000639501 POLA2Q14181 598 aa24.39■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 OGFRQ9NZT2 677 aa24.39■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 KLHL34Q8N239 644 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 NUTM2FA1L443 756 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 SMTNL1A8MU46 457 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 TNNT1P13805 278 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 VPS53Q5VIR6 699 aa24.38■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.38■■□□□ 1.49
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PMS1-222ENST00000639501 DACT1Q9NYF0 836 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 RAB11FIP3O75154 756 aa24.37■■□□□ 1.49
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PMS1-222ENST00000639501 TBX22Q9Y458 520 aa24.37■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 SRGAP3O43295 1099 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ZNF75DP51815 510 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 LRRC37A3O60309 1634 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.36■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 KRT85P78386 507 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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PMS1-222ENST00000639501 TRIM5Q9C035 493 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 TNMDQ9H2S6 317 aa24.35■■□□□ 1.49
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PMS1-222ENST00000639501 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.35■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 TECPR2O15040 1411 aa24.35■■□□□ 1.49
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PMS1-222ENST00000639501 PTPRUQ92729 1446 aa24.34■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 DIP2AQ14689 1571 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 SYCP1Q15431 976 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PMS1-222ENST00000639501 KDRP35968 1356 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K5Q99683 1374 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-222ENST00000639501 ELP1O95163 1332 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-222ENST00000639501 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-222ENST00000639501 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.32■■□□□ 1.48
PMS1-222ENST00000639501 CACNA1FO60840 1977 aa24.32■■□□□ 1.48
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