RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IVL	P07476	585 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CAMK4	Q16566	473 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCND1	Q9NSA2	647 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RGS12	O14924	1447 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADGRB2	O60241	1585 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP152	O94986	1710 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694		H3BQF6	201 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDC25B	P30305	580 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEMF	O60524	1076 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC69	A6NI79	296 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	F13A1	P00488	732 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYT1	P21579	422 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBXN4	Q92575	508 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STX6	O43752	255 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MTHFS	P49914	203 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MORC1	Q86VD1	984 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TADA3	O75528	432 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LIG1	P18858	919 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAP9	Q49MG5	647 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FUT8	Q9BYC5	575 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLCH2	O75038	1416 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MCC	P23508	829 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYOM2	P54296	1465 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HSPA2	P54652	639 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KAT2B	Q92831	832 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SCP2	P22307	547 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF165	P49910	485 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FANCG	O15287	622 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANAPC15	P60006	121 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERVK-7	P63135	1459 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GNAI3	P08754	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRDN	Q13061	729 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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