RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636402.1

KCNC4-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

TSL 5

Gene KCNC4, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4-208ENST00000636402 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.53■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 HYPKQ9NX55 129 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.52■□□□□ 0.88
KCNC4-208ENST00000636402 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 SLFN5Q08AF3 891 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 SYT17Q9BSW7 474 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 NUP98P52948 1817 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 COPS6Q7L5N1 327 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 ATP10DQ9P241 1426 aa20.49■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 VAMP4O75379 141 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 HLFQ16534 295 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 CACNA1FO60840 1977 aa20.48■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 SETDB2Q96T68 719 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.47■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 SERPINB2P05120 415 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 KLHL34Q8N239 644 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 STK31Q9BXU1 1019 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNC4-208ENST00000636402 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.43■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 TGFB2P61812 414 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 ZNF428Q96B54 188 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 SLC4A2P04920 1241 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 PARP10Q53GL7 1025 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 CNBD1Q8NA66 436 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNC4-208ENST00000636402 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 TCIRG1Q13488 830 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 GPTP24298 496 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 NYXQ9GZU5 481 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ST5P78524 1137 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 FLIIQ13045 1269 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 G2E3Q7L622 706 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 KSR2Q6VAB6 950 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.36■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ADCY9O60503 1353 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 NPHP1O15259 732 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 NTSR2O95665 410 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 SUSD4Q5VX71 490 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 NLRP10Q86W26 655 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.34■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 DPEP1P16444 411 aa20.34■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 FAM177BA6PVY3 158 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 PDE6BP35913 854 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.33■□□□□ 0.85
KCNC4-208ENST00000636402 ABCC12Q96J65 1359 aa20.33■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 A0A0G2JLW4 131 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 KCNA3P22001 575 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.31■□□□□ 0.84
KCNC4-208ENST00000636402 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms