RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ3O43525 872 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 SRGNP10124 158 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CREBZFQ9NS37 354 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEIP0CG38 1075 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEJP0CG39 1038 aa36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PCNTO95613 3336 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAR2BP31323 418 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF652Q9Y2D9 606 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 USP16Q9Y5T5 823 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC93Q567U6 631 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP53Q96M91 514 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SLX4Q8IY92 1834 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHDQ86WU2 507 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 NPR1P16066 1061 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC4GQ6UXB4 293 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM177BA6PVY3 158 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 BCORQ6W2J9 1755 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDCQ9Y266 331 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM10Q7L590 875 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1SQ13698 1873 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP1P78357 1384 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC11AQ9Y240 323 aa36.57■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PASKQ96RG2 1323 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFM4Q6UX06 510 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 AIDAQ96BJ3 306 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 HACL1Q9UJ83 578 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXN1O15353 648 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RTKN2Q8IZC4 609 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTN1Q14203 1278 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF26B4DH59 902 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF15Q8N660 670 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHX2P34913 555 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 VEGFBP49765 207 aa36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1B1P30837 517 aa36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 IARSP41252 1262 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNE4Q8N205 404 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 HLFQ16534 295 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN4AP35499 1836 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RGL2O15211 777 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NGEFQ8N5V2 710 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM10Q9NQV6 1147 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 JDP2Q8WYK2 163 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD9O00144 591 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTROBQ8N137 903 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NYXQ9GZU5 481 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MIS18AQ9NYP9 233 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA3Q9Y6H8 435 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 GPC2Q8N158 579 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R1AP30153 589 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF6P56537 245 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC12Q96J65 1359 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD1Q99460 953 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 LBX1P52954 281 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF6Q6ZMV9 814 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 WBP1LQ9NX94 342 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NEFMP07197 916 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa36.32■■■■□ 3.4
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