RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	CEP85	Q6P2H3	762 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	RXRB	P28702	533 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYD88	Q99836	296 aa		31.22	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.2	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMC5	Q8IY18	1101 aa		31.2	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.2	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	LY75	O60449	1722 aa		31.2	■■■□□ 2.59
CAPNS1-215	ENST00000628018	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	UTY	O14607	1347 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	GCKR	Q14397	625 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	GRM8	O00222	908 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	GCC1	Q96CN9	775 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CAPNS1-215	ENST00000628018	SKAP1	Q86WV1	359 aa		31.14	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP8B2	P98198	1209 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	HMMR	O75330	724 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCTPP1	Q9H773	170 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	KCNQ4	P56696	695 aa		31.1	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM37	O94972	964 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARX	Q96QS3	562 aa		31.08	■■■□□ 2.57
CAPNS1-215	ENST00000628018	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUCB1	Q02818	461 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.06	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	HLF	Q16534	295 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.05	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018		A0A087WZG4	1122 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	MTX1	Q13505	466 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	SSH3	Q8TE77	659 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	NUP98	P52948	1817 aa		31.04	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	CASP7	P55210	303 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL15A1	P39059	1388 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018		H7C1W4	665 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	POLA2	Q14181	598 aa		31.03	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	EP400	Q96L91	3159 aa		31.01	■■■□□ 2.56
CAPNS1-215	ENST00000628018	RGS3	P49796	1198 aa		31.01	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		31	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	C4B	P0C0L5	1744 aa		31	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	RPS6KA4	O75676	772 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	CAMTA2	O94983	1202 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		30.99	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	SRGAP3	O43295	1099 aa		30.98	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		30.98	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		30.98	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDE4A	P27815	886 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		30.96	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	NLRP10	Q86W26	655 aa		30.95	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	LNPK	Q9C0E8	428 aa		30.95	■■■□□ 2.55
CAPNS1-215	ENST00000628018	GNPAT	O15228	680 aa		30.93	■■■□□ 2.54
CAPNS1-215	ENST00000628018	GPT	P24298	496 aa		30.93	■■■□□ 2.54
CAPNS1-215	ENST00000628018	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLSCR1	O15162	318 aa		30.93	■■■□□ 2.54
CAPNS1-215	ENST00000628018	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54

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