RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 CNTROBQ8N137 903 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PTH1RQ03431 593 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PDIA6Q15084 440 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ALS2Q96Q42 1657 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 DTNBO60941 627 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 KSR2Q6VAB6 950 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 SUCLG2Q96I99 432 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ST3GAL1Q11201 340 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH1L1O75891 902 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MBD3O95983 291 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 USP48Q86UV5 1035 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 UTYO14607 1347 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MRC1P22897 1456 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SASH1O94885 1247 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HYPKQ9NX55 129 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KCNB2Q92953 911 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GLI3P10071 1580 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV5-2P06315 115 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 COL18A1P39060 1754 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KIF1AQ12756 1690 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GRM8O00222 908 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SYT1P21579 422 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 AACSQ86V21 672 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RNF214Q8ND24 703 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ERBB3P21860 1342 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MST1RQ04912 1400 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 FAM227BQ96M60 508 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SLC39A6Q13433 755 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NECTIN1Q15223 517 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LINS1Q8NG48 757 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MEGF6O75095 1541 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HS1BP3Q53T59 392 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
C9orf170-201ENST00000623052 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 STX6O43752 255 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EVI5LQ96CN4 794 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TSPY26PQ9H489 355 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SNRKQ9NRH2 765 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0D9SFI3 127 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 VPS53Q5VIR6 699 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 F13A1P00488 732 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 JCADQ9P266 1359 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ME3Q16798 604 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF790Q6PG37 636 aa16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MED23Q9ULK4 1368 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 OFD1O75665 1012 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms