RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619529.1

LINC00854-215, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-215	ENST00000619529	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	MCM10	Q7L590	875 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	ST5	P78524	1137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	HLF	Q16534	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NPHP1	O15259	732 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	NPR1	P16066	1061 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	PCNT	O95613	3336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LINC00854-215	ENST00000619529	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	RGL2	O15211	777 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.67	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.66	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	FZD9	O00144	591 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
LINC00854-215	ENST00000619529	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	FOXN1	O15353	648 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	EPHX2	P34913	555 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	VEGFB	P49765	207 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	COL4A5	P29400	1685 aa		13.63	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	SCN4A	P35499	1836 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	PSMD1	Q99460	953 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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