RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616545.4

TARDBP-217, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TARDBP, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-217ENST00000616545 C4BP0C0L5 1744 aa14.75□□□□□ -0.05
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TARDBP-217ENST00000616545 COL15A1P39059 1388 aa14.74□□□□□ -0.05
TARDBP-217ENST00000616545 GNPATO15228 680 aa14.74□□□□□ -0.05
TARDBP-217ENST00000616545 ALDH1L1O75891 902 aa14.74□□□□□ -0.05
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TARDBP-217ENST00000616545 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.062e-11■■■□□ 15.1
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TARDBP-217ENST00000616545 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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TARDBP-217ENST00000616545 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 SETDB2Q96T68 719 aa14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 MEIS3Q99687 375 aa14.62□□□□□ -0.07
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