RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 LRRC27Q9C0I9 530 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 GAPVD1Q14C86 1478 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 UBE4AQ14139 1066 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 GBP6Q6ZN66 633 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 DAPK1P53355 1430 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP58Q5T655 872 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 IFT74Q96LB3 600 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 ABCC11Q96J66 1382 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 PIP4K2BP78356 416 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 MSH5O43196 834 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CTAGE9A4FU28 777 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC160A6NGH7 325 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 C8orf76Q96K31 380 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 MGEA5O60502 916 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 EBAG9O00559 213 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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PTPRT-209ENST00000612229 KDM4AO75164 1064 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRT-209ENST00000612229 WDR78Q5VTH9 848 aa7.97□□□□□ -1.13
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