RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 HLFQ16534 295 aa16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1-209ENST00000607882 C4AP0C0L4 1744 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 NARFQ9UHQ1 456 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-209ENST00000607882 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.18■□□□□ 0.18
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RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.14■□□□□ 0.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP350Q5VT06 3117 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 COPS6Q7L5N1 327 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.1■□□□□ 0.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.09■□□□□ 0.17
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RABGEF1-209ENST00000607882 IFT57Q9NWB7 429 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-209ENST00000607882 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.08■□□□□ 0.16
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RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa16.07■□□□□ 0.16
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RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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RABGEF1-209ENST00000607882 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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RABGEF1-209ENST00000607882 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC27Q2M243 656 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCC12Q96J65 1359 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-209ENST00000607882 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.99■□□□□ 0.15
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