RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 SYCE3A1L190 88 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 HYPKQ9NX55 129 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.29■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.29■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 AK2P54819 239 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 KAZALD1Q96I82 304 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 LINS1Q8NG48 757 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 GRM8O00222 908 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 RUFY3Q7L099 469 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 SUCLG2Q96I99 432 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 UTYO14607 1347 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 C5P01031 1676 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM44-210ENST00000599939 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ERBB3P21860 1342 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 PDIA6Q15084 440 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 GPATCH3Q96I76 525 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 PTH1RQ03431 593 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 AACSQ86V21 672 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 KIF1AQ12756 1690 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 CPA1P15085 419 aa24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 SASH1O94885 1247 aa24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 EVI5LQ96CN4 794 aa24.22■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ALS2Q96Q42 1657 aa24.22■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 IGKV5-2P06315 115 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 USP48Q86UV5 1035 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 MST1RQ04912 1400 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 LARGE1O95461 756 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 SLC39A6Q13433 755 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF790Q6PG37 636 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 KCNB2Q92953 911 aa24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
TIMM44-210ENST00000599939 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 HS1BP3Q53T59 392 aa24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 SYT1P21579 422 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 STX6O43752 255 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 VPS53Q5VIR6 699 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 NECTIN1Q15223 517 aa24.17■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.17■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.17■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 FAM227BQ96M60 508 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 MRC1P22897 1456 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 MYL6BP14649 208 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 RNF214Q8ND24 703 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 SIL1Q9H173 461 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 MEGF6O75095 1541 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 TSPY26PQ9H489 355 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 PHKG2P15735 406 aa24.14■■□□□ 1.46
TIMM44-210ENST00000599939 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms