RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 IFFO2Q5TF58 517 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-208ENST00000590422 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTIF-208ENST00000590422 NBPF15Q8N660 670 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-208ENST00000590422 SETDB2Q96T68 719 aa16.15■□□□□ 0.18
CTIF-208ENST00000590422 GLTPD2A6NH11 291 aa16.14■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 FSTL1Q12841 308 aa16.14■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.13■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 PCNTO95613 3336 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 NPHP1O15259 732 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 SRGNP10124 158 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 ST5P78524 1137 aa16.12■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
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CTIF-208ENST00000590422 STYK1Q6J9G0 422 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 POTECB2RU33 542 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.1■□□□□ 0.17
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CTIF-208ENST00000590422 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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CTIF-208ENST00000590422 ERFEQ4G0M1 354 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 CNKSR1Q969H4 720 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 MASTLQ96GX5 879 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 NUP98P52948 1817 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-208ENST00000590422 KLRG1Q96E93 195 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 FAM177BA6PVY3 158 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 ABCC12Q96J65 1359 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 OLFM4Q6UX06 510 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 RGL2O15211 777 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 NFE2L2Q16236 605 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 NGEFQ8N5V2 710 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 JMYQ8N9B5 988 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 NPR1P16066 1061 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 SNED1Q8TER0 1413 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 POTEIP0CG38 1075 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 POTEJP0CG39 1038 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 CCDC93Q567U6 631 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 SOGA3Q5TF21 947 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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CTIF-208ENST00000590422 NEFMP07197 916 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-208ENST00000590422 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 MYL6BP14649 208 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 SLC51AQ86UW1 340 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 SCN4AP35499 1836 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 COL4A5P29400 1685 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ERVV-1B6SEH8 477 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 CRY2Q49AN0 593 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 GPTP24298 496 aa15.99■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 PROSER3Q2NL68 480 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 SUSD4Q5VX71 490 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 CHADLQ6NUI6 762 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 NYXQ9GZU5 481 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 PDIA6Q15084 440 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-208ENST00000590422 ERBB4Q15303 1308 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 LAMB2P55268 1798 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 NTSR2O95665 410 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 ANXA1P04083 346 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 RIPK4P57078 832 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 SYNE4Q8N205 404 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-208ENST00000590422 LTBP1Q14766 1721 aa15.94■□□□□ 0.14
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