RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AAMPQ13685 434 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHD4Q14839 1912 aa9.34□□□□□ -0.91
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.34□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VAMP4O75379 141 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCAR3O75815 825 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A1BGP04217 495 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NFIXQ14938 502 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCS1LQ9Y276 419 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USP16Q9Y5T5 823 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.33□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLIN1O60240 522 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNA3P22001 575 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A087WZG4 1122 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SERPINB2P05120 415 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHRNA5P30532 468 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HOXB7P09629 217 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PIM2Q9P1W9 311 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP10DQ9P241 1426 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CAMTA2O94983 1202 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TSPYL6Q8N831 410 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 STK31Q9BXU1 1019 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ADCY9O60503 1353 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRBNQ96SW2 442 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCN7AQ01118 1682 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PTPRCP08575 1304 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF26B4DH59 902 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1QTNF8P60827 252 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NBPF15Q8N660 670 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRIM27P14373 513 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SETDB2Q96T68 719 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H0YIN7 160 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NPHP1O15259 732 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CNBD1Q8NA66 436 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COG6Q9Y2V7 657 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCORQ6W2J9 1755 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC4A2P04920 1241 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDE6BP35913 854 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRT24Q2M2I5 525 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TTLL6Q8N841 843 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PANK1Q8TE04 598 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM177BA6PVY3 158 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms