RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPRC	P08575	1304 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	MYL6B	P14649	208 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	HLF	Q16534	295 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	NUP98	P52948	1817 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	ABCC4	O15439	1325 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	GYS1	P13807	737 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIM27	P14373	513 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	TM4SF1	P30408	202 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMUB2-208	ENST00000587775	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775		A0A087WZG4	1122 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	RLBP1	P12271	317 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	AK7	Q96M32	723 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	UTY	O14607	1347 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775		F6X3S4	739 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	CASP7	P55210	303 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	FKBP8	Q14318	412 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	PLIN1	O60240	522 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775		H7C1W4	665 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	RFC4	P35249	363 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	NFIX	Q14938	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	PHF14	O94880	888 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	DDR1	Q08345	913 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	NTSR2	O95665	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	PTGER2	P43116	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	GCKR	Q14397	625 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMUB2-208	ENST00000587775	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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