RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580445.5

OGFOD3-208, Transcript of 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OGFOD3, Length 1,274 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3-208ENST00000580445 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.15■■■□□ 2.1
OGFOD3-208ENST00000580445 NGEFQ8N5V2 710 aa28.15■■■□□ 2.1
OGFOD3-208ENST00000580445 PDE6BP35913 854 aa28.14■■■□□ 2.1
OGFOD3-208ENST00000580445 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.14■■■□□ 2.1
OGFOD3-208ENST00000580445 ST5P78524 1137 aa28.13■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 RNF181Q9P0P0 153 aa28.13■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.12■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 RASSF7Q02833 373 aa28.12■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 MYL6BP14649 208 aa28.11■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 RUNDC1Q96C34 613 aa28.11■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 SLX4Q8IY92 1834 aa28.11■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 HLFQ16534 295 aa28.1■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.1■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.1■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.09■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 FAM177BA6PVY3 158 aa28.09■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.08■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
OGFOD3-208ENST00000580445 KIF3CO14782 793 aa28.07■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 RGL2O15211 777 aa28.07■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.06■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.05■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.05■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.05■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 C21orf2O43822 256 aa28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 SRGNP10124 158 aa28.03■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.03■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 ERBB4Q15303 1308 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 NFKBIEO00221 500 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 PRELPP51888 382 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 STYK1Q6J9G0 422 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 MASTLQ96GX5 879 aa28.02■■■□□ 2.08
OGFOD3-208ENST00000580445 LMNB1P20700 586 aa28.01■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 CNKSR1Q969H4 720 aa28.01■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.99■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 ANXA1P04083 346 aa27.99■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 NECTIN2Q92692 538 aa27.99■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.98■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 CHL1O00533 1208 aa27.98■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 GPTP24298 496 aa27.98■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 KRT24Q2M2I5 525 aa27.98■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 PROSER3Q2NL68 480 aa27.98■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 CEP350Q5VT06 3117 aa27.97■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 PDIA6Q15084 440 aa27.97■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 NPR1P16066 1061 aa27.96■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.96■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 NYXQ9GZU5 481 aa27.96■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 ABCC12Q96J65 1359 aa27.96■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.95■■■□□ 2.07
OGFOD3-208ENST00000580445 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.95■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 APAF1O14727 1248 aa27.93■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 TOMM70O94826 608 aa27.93■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 ERFEQ4G0M1 354 aa27.93■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 HSPA6P17066 643 aa27.92■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.92■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.92■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 RRAGCQ9HB90 399 aa27.92■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 SOGA3Q5TF21 947 aa27.91■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 SUSD4Q5VX71 490 aa27.91■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC184Q52MB2 194 aa27.89■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 COPS6Q7L5N1 327 aa27.89■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.89■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 CFAP44Q96MT7 982 aa27.89■■■□□ 2.06
OGFOD3-208ENST00000580445 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.89■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 GLTPD2A6NH11 291 aa27.88■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.88■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 LAMB2P55268 1798 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 NTSR2O95665 410 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 CCDC93Q567U6 631 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 OLFM4Q6UX06 510 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.058e-7■■■■■ 27.9
OGFOD3-208ENST00000580445 MBIPQ9NS73 344 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.87■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.86■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.86■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 ALDH1B1P30837 517 aa27.85■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 CRY2Q49AN0 593 aa27.85■■■□□ 2.05
OGFOD3-208ENST00000580445 PARP10Q53GL7 1025 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms