RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 LUZP1Q86V48 1076 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 IQCA1Q86XH1 822 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP5P59047 1200 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DNA2P51530 1060 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 TIGD1Q96MW7 591 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 MBIPQ9NS73 344 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 VPS36Q86VN1 386 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 IQGAP2Q13576 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CETN2P41208 172 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 TNIP1Q15025 636 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 KIF14Q15058 1648 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 MCM5P33992 734 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WZG4 1122 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2HP62256 183 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 GOLIM4O00461 696 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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PTPRM-211ENST00000580170 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 UVSSAQ2YD98 709 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 RAB34Q9BZG1 259 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 GOPCQ9HD26 462 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 NSD2O96028 1365 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 NEBLO76041 1014 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 USP16Q9Y5T5 823 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRM-211ENST00000580170 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
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PTPRM-211ENST00000580170 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 PAFAH1B1P43034 410 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 NUCB1Q02818 461 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRM-211ENST00000580170 NEK1Q96PY6 1258 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF165P49910 485 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC96Q2M329 555 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ISM2Q6H9L7 571 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM83GA6ND36 823 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 POTEB2H3BUK9 544 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ZPR1O75312 459 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 CEP135Q66GS9 1140 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 TMX3Q96JJ7 454 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 PANK2Q9BZ23 570 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 IL16Q14005 1332 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3R4Q99570 1358 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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PTPRM-211ENST00000580170 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 KIF20AO95235 890 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 LMAN1P49257 510 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-211ENST00000580170 NOS1P29475 1434 aa24.58■■□□□ 1.52
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