RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	MAN1A2	O60476	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	PTK2	Q05397	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	PLCH2	O75038	1416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NSF-208	ENST00000576346	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	YY1	P25490	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TMF1	P82094	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	AGER	Q15109	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	MYOM2	P54296	1465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	KANK1	Q14678	1352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZBBX	A8MT70	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SOX11	P35716	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	BMP2	P12643	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	RASSF7	Q02833	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	NR1H3	Q13133	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346		Q6ZVU0	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SPINT1	O43278	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	UPP2	O95045	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	PTS	Q03393	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	IRF5	Q13568	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	KIF1B	O60333	1816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	FSHR	P23945	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSF-208	ENST00000576346	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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