RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.66■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 SRGNP10124 158 aa23.66■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.66■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 CNTNAP1P78357 1384 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 FOXN1O15353 648 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 MASTLQ96GX5 879 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 SCN4AP35499 1836 aa23.65■■□□□ 1.38
CCDC40-211ENST00000574099 KCNQ3O43525 872 aa23.64■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 SOGA3Q5TF21 947 aa23.64■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 LDHDQ86WU2 507 aa23.63■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 PASKQ96RG2 1323 aa23.62■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.62■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC93Q567U6 631 aa23.61■■□□□ 1.37
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CCDC40-211ENST00000574099 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.6■■□□□ 1.37
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CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.59■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 BTBD11A6QL63 1104 aa23.59■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 VEGFBP49765 207 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 OLFM4Q6UX06 510 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 AIDAQ96BJ3 306 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 USP16Q9Y5T5 823 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 FAM177BA6PVY3 158 aa23.56■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 NPR1P16066 1061 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 HACL1Q9UJ83 578 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 PRKAR2BP31323 418 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 EPHX2P34913 555 aa23.53■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-211ENST00000574099 LBX1P52954 281 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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CCDC40-211ENST00000574099 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 MCM10Q7L590 875 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 WBP1LQ9NX94 342 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF26B4DH59 902 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 CNTROBQ8N137 903 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 SYNE4Q8N205 404 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF15Q8N660 670 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 FZD9O00144 591 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 HLFQ16534 295 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-211ENST00000574099 COL4A5P29400 1685 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 RASSF10A6NK89 507 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 DCTN1Q14203 1278 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 LTBP1Q14766 1721 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 ABCC12Q96J65 1359 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH1B1P30837 517 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 GPC2Q8N158 579 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 SNED1Q8TER0 1413 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 JDP2Q8WYK2 163 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 CFAP53Q96M91 514 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 NUP98P52948 1817 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 NGEFQ8N5V2 710 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 SLC51AQ86UW1 340 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 ABHD8Q96I13 439 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC40-211ENST00000574099 PSMD1Q99460 953 aa23.4■■□□□ 1.34
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