RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570600.5

TMEM256-PLSCR3-202, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 1,526 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KLHL34Q8N239 644 aa25.28■■□□□ 1.64
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 COPS6Q7L5N1 327 aa25.27■■□□□ 1.64
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ATP10DQ9P241 1426 aa25.13■■□□□ 1.61
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TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.03■■□□□ 1.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ST5P78524 1137 aa25.02■■□□□ 1.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 F6X3S4 739 aa25.01■■□□□ 1.59
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.598e-10■■■■□ 20.6
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.01■■□□□ 1.59
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