RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRGNP10124 158 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRKAR2BP31323 418 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 SOGA3Q5TF21 947 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 MASTLQ96GX5 879 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCORQ6W2J9 1755 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 CACNA1SQ13698 1873 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLX4Q8IY92 1834 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 CFAP53Q96M91 514 aa23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 USP16Q9Y5T5 823 aa23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHADLQ6NUI6 762 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCNTO95613 3336 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 CREBZFQ9NS37 354 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUDCQ9Y266 331 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 POTEIP0CG38 1075 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 POTEJP0CG39 1038 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC93Q567U6 631 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCM10Q7L590 875 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-210ENST00000561256 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPR1P16066 1061 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 LDHDQ86WU2 507 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM177BA6PVY3 158 aa23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCN4AP35499 1836 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF26B4DH59 902 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCTN1Q14203 1278 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF15Q8N660 670 aa23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGL2O15211 777 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.02■■□□□ 1.28
USP3-AS1-210ENST00000561256 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 PASKQ96RG2 1323 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNTNAP1P78357 1384 aa23.01■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 OLFM4Q6UX06 510 aa23■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP2R1AP30153 589 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALDH1B1P30837 517 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 HACL1Q9UJ83 578 aa22.99■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 HLFQ16534 295 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.98■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 EPHX2P34913 555 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNE4Q8N205 404 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.96■■□□□ 1.27
USP3-AS1-210ENST00000561256 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 FOXN1O15353 648 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 NGEFQ8N5V2 710 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 NYXQ9GZU5 481 aa22.95■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 FZD9O00144 591 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 AIDAQ96BJ3 306 aa22.94■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEFMP07197 916 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 VEGFBP49765 207 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 JDP2Q8WYK2 163 aa22.93■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCC12Q96J65 1359 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPC2Q8N158 579 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSMD1Q99460 953 aa22.92■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRY2Q49AN0 593 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.91■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNTROBQ8N137 903 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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