RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.97□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.97□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.97□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 MYL6BP14649 208 aa11.96□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 PDE6BP35913 854 aa11.96□□□□□ -0.49
MFGE8-213ENST00000560553 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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MFGE8-213ENST00000560553 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.95□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 NUP98P52948 1817 aa11.95□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.94□□□□□ -0.5
MFGE8-213ENST00000560553 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.94□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 C21orf2O43822 256 aa11.93□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.92□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 NECTIN2Q92692 538 aa11.92□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 SRGNP10124 158 aa11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-213ENST00000560553 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
MFGE8-213ENST00000560553 STYK1Q6J9G0 422 aa11.91□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 PROSER3Q2NL68 480 aa11.9□□□□□ -0.5
MFGE8-213ENST00000560553 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.9□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.9□□□□□ -0.5
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MFGE8-213ENST00000560553 HSPA6P17066 643 aa11.88□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 SUSD4Q5VX71 490 aa11.87□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 OLFM4Q6UX06 510 aa11.87□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 SOGA3Q5TF21 947 aa11.86□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.86□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.85□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.85□□□□□ -0.51
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MFGE8-213ENST00000560553 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF428Q96B54 188 aa11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 CFAP44Q96MT7 982 aa11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
MFGE8-213ENST00000560553 MBIPQ9NS73 344 aa11.84□□□□□ -0.51
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