RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 COPS6Q7L5N1 327 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.16■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 HYPKQ9NX55 129 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.15■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.14■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.14■■□□□ 1.78
TSPAN3-207ENST00000559494 RGL2O15211 777 aa26.14■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 SCN7AQ01118 1682 aa26.13■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 BCORQ6W2J9 1755 aa26.13■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 SYT17Q9BSW7 474 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 KLHL34Q8N239 644 aa26.11■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 SERPINB2P05120 415 aa26.1■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 SETDB2Q96T68 719 aa26.1■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 STK31Q9BXU1 1019 aa26.1■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 NUP98P52948 1817 aa26.09■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC4A2P04920 1241 aa26.09■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.08■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.08■■□□□ 1.77
TSPAN3-207ENST00000559494 G2E3Q7L622 706 aa26.07■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.07■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.07■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.06■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.05■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.04■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 CACNA1FO60840 1977 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 GPTP24298 496 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 TCIRG1Q13488 830 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 ATP10DQ9P241 1426 aa26.03■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.02■■□□□ 1.76
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM177BA6PVY3 158 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 FLIIQ13045 1269 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 SUSD4Q5VX71 490 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 KSR2Q6VAB6 950 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 CNBD1Q8NA66 436 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 TGFB2P61812 414 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF428Q96B54 188 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 A0A0G2JLW4 131 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 PARP10Q53GL7 1025 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 NLRP10Q86W26 655 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN3-207ENST00000559494 ADCY9O60503 1353 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 NPHP1O15259 732 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 DPEP1P16444 411 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 MYD88Q99836 296 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 NYXQ9GZU5 481 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 NTSR2O95665 410 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNA3P22001 575 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 CHRNA5P30532 468 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ST5P78524 1137 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ERFEQ4G0M1 354 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TSPAN3-207ENST00000559494 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms