RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ECM1Q16610 540 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 DBN1Q16643 649 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 C4orf17Q53FE4 359 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ERCC3P19447 782 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGAP4P98171 946 aa5.13□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 CDK2AP1O14519 115 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 SLURP2P0DP57 97 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 PHKA2P46019 1235 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 C16orf46Q6P387 395 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 POTEAQ6S8J7 498 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 TNFRSF10BO14763 440 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 NPR3P17342 541 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 MPSTP25325 297 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 MSX1P28360 303 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 MAPK1P28482 360 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 GAS6Q14393 721 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 PGBD3Q8N328 593 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 MBIPQ9NS73 344 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.1□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 PLA2G4AP47712 749 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 EFHC2Q5JST6 749 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ASB16Q96NS5 453 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 GPAMQ9HCL2 828 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 PHF24Q9UPV7 400 aa5.1□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 FAM13AO94988 1023 aa5.09□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 THBS1P07996 1170 aa5.09□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 COX20Q5RI15 118 aa5.09□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 MYO19Q96H55 970 aa5.09□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.09□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
TMOD3-205ENST00000558714 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.09□□□□□ -1.59
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TMOD3-205ENST00000558714 GPR25O00155 361 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 ATP4AP20648 1035 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 NGLY1Q96IV0 654 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 RUBCNLQ9H714 662 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 223.6
TMOD3-205ENST00000558714 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 E9PSI1 815 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 MX2P20592 715 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 FAM26DQ5JW98 314 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 NLRP8Q86W28 1048 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 SVOPQ8N4V2 548 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 GIPC2Q8TF65 315 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 CABP1Q9NZU7 370 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 STIM2Q9P246 746 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 IGF1RP08069 1367 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 NDUFB5O43674 189 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 FZD6O60353 706 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGEF15O94989 841 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 NOS2P35228 1153 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD3-205ENST00000558714 MAP2K3P46734 347 aa5.06□□□□□ -1.6
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