RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556485.5

LRMP-216, Transcript of lymphoid restricted membrane protein, humanhuman

TSL 5

Gene LRMP, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMP-216ENST00000556485 HCN2Q9UL51 889 aa9.28□□□□□ -0.92
LRMP-216ENST00000556485 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRMP-216ENST00000556485 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.28□□□□□ -0.92
LRMP-216ENST00000556485 USP17L15C9J2P7 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L10C9JJH3 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L12C9JPN9 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L11C9JVI0 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L21D6R901 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L18D6R9N7 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L22D6RA61 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L19D6RCP7 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L20D6RJB6 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 USP17L24Q0WX57 530 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 PTK7Q13308 1070 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.27□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ADH6P28332 368 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 MARK1Q9P0L2 795 aa9.26□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 C21orf2O43822 256 aa9.25□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 EPXP11678 715 aa9.25□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 DPYDQ12882 1025 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 STRN4Q9NRL3 753 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.24□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 AMPD1P23109 780 aa9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.23□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 RRAGCQ9HB90 399 aa9.22□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.22□□□□□ -0.93
LRMP-216ENST00000556485 HIF1AQ16665 826 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 HINFPQ9BQA5 517 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 KLF15Q9UIH9 416 aa9.21□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 IGFBP4P22692 258 aa9.2□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 ARXQ96QS3 562 aa9.2□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 PIK3R2O00459 728 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 TYRO3Q06418 890 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 CHSY3Q70JA7 882 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 DCAF5Q96JK2 942 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 BTBD6Q96KE9 485 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SUSD3Q96L08 255 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 BRD7Q9NPI1 651 aa9.19□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 IGHA1P01876 353 aa9.18□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 DGKGP49619 791 aa9.18□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 CEP63Q96MT8 703 aa9.18□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 KCNQ4P56696 695 aa9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 RTN1Q16799 776 aa9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SYT9Q86SS6 491 aa9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 NGLY1Q96IV0 654 aa9.17□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 GNB5O14775 395 aa9.16□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SIN3BO75182 1162 aa9.16□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.16□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.16□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.16□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 FOXO3O43524 673 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 LGR5O75473 907 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SPEM2Q0P670 501 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 NEUROD1Q13562 356 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 GRIN2CQ14957 1233 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 IER5Q5VY09 327 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 SLC30A3Q99726 388 aa9.15□□□□□ -0.94
LRMP-216ENST00000556485 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 ELOA3Q8NG57 546 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 MDFIQ99750 246 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.14□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.13□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 RFX1P22670 979 aa9.13□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 WEE1P30291 646 aa9.13□□□□□ -0.95
LRMP-216ENST00000556485 TNFRSF25Q93038 417 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms