RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 XBP1P17861 261 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 LCA5Q86VQ0 697 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf38Q8TB03 319 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR7Q9Y216 660 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NEBLO76041 1014 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0754O94854 1291 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MCM5P33992 734 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TCIRG1Q13488 830 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 WASHC4Q2M389 1173 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NPATQ14207 1427 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IVLP07476 585 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 GBP6Q6ZN66 633 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HOOK2Q96ED9 719 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 EYA3Q99504 573 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ACEP12821 1306 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PDE6BP35913 854 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 FOSBP53539 338 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SETDB1Q15047 1291 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 LDHCP07864 332 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CTAGE5O15320 804 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HYPKQ9NX55 129 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 OGFRQ9NZT2 677 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ADRA2BP18089 450 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 KRT222Q8N1A0 295 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ERCC3P19447 782 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 OFD1O75665 1012 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 TRAF1Q13077 416 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 INF2Q27J81 1249 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 WDR63Q8IWG1 891 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NFE2L2Q16236 605 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 REC8O95072 547 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA3FQ13275 785 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ST18O60284 1047 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SAMD9Q5K651 1589 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 APAF1O14727 1248 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 KIF2CQ99661 725 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 APLP1P51693 650 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-210ENST00000551525 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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