RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 USP16Q9Y5T5 823 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 BTBD11A6QL63 1104 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 ST5P78524 1137 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 CHADLQ6NUI6 762 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 FAM177BA6PVY3 158 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 SRGNP10124 158 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 OLFM4Q6UX06 510 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 CNKSR1Q969H4 720 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 BCORQ6W2J9 1755 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 PRKAR2BP31323 418 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 STYK1Q6J9G0 422 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 MASTLQ96GX5 879 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-227ENST00000551441 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 MCM10Q7L590 875 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 CREBZFQ9NS37 354 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 DCTN1Q14203 1278 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 FOXN1O15353 648 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 CCDC93Q567U6 631 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-227ENST00000551441 NBPF26B4DH59 902 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 SOGA3Q5TF21 947 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 NBPF15Q8N660 670 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 NPR1P16066 1061 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 HLFQ16534 295 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 LDHDQ86WU2 507 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 NGEFQ8N5V2 710 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 PASKQ96RG2 1323 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 CNTNAP1P78357 1384 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 SCN4AP35499 1836 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 VEGFBP49765 207 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 CFAP53Q96M91 514 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 SLC51AQ86UW1 340 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 SYNE4Q8N205 404 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 HACL1Q9UJ83 578 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-227ENST00000551441 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 EPHX2P34913 555 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 NUDCQ9Y266 331 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 PPP2R1AP30153 589 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 AIDAQ96BJ3 306 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 ABCC12Q96J65 1359 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 CNTROBQ8N137 903 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 GPTP24298 496 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 ALDH1B1P30837 517 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 LBX1P52954 281 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-227ENST00000551441 COL4A5P29400 1685 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 FZD9O00144 591 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 NUP98P52948 1817 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 MYL6BP14649 208 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 JDP2Q8WYK2 163 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CS-227ENST00000551441 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.43■■□□□ 1.02
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