RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.42■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.41■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 AOC2O75106 756 aa20.4■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 STYK1Q6J9G0 422 aa20.4■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 OLFM4Q6UX06 510 aa20.4■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.4■□□□□ 0.86
USP15-216ENST00000550632 NPHP1O15259 732 aa20.39■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 SRGNP10124 158 aa20.39■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 SOGA3Q5TF21 947 aa20.39■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.39■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 ECE1P42892 770 aa20.38■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 CNBD1Q8NA66 436 aa20.38■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 MASTLQ96GX5 879 aa20.38■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.38■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 LTBP1Q14766 1721 aa20.37■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 CCDC93Q567U6 631 aa20.37■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.37■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.36■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 A0A087WZG4 1122 aa20.36■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 DGKZQ13574 1117 aa20.36■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 TRAF5O00463 557 aa20.35■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.35■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.34■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 ST5P78524 1137 aa20.34■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 CST9Q5W186 159 aa20.34■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 SETDB2Q96T68 719 aa20.34■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 SCN7AQ01118 1682 aa20.34■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.33■□□□□ 0.85
USP15-216ENST00000550632 MRC1P22897 1456 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 FZD9O00144 591 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 STARD3NLO95772 234 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.32■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 SOX10P56693 466 aa20.31■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 GPC2Q8N158 579 aa20.31■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.31■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 SYNE4Q8N205 404 aa20.3■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 CAMTA2O94983 1202 aa20.29■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 MAP2K2P36507 400 aa20.29■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 EPS15P42566 896 aa20.29■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.27■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 NPR1P16066 1061 aa20.27■□□□□ 0.84
USP15-216ENST00000550632 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 A1BGP04217 495 aa20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 IL13P35225 146 aa20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 CA12O43570 354 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 SCNN1DP51172 638 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 JDP2Q8WYK2 163 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 COL4A5P29400 1685 aa20.25■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.24■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 HMOX1P09601 288 aa20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 ZIC5Q96T25 663 aa20.23■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.22■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 FAM177BA6PVY3 158 aa20.22■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP15-216ENST00000550632 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 MORC1Q86VD1 984 aa20.2■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 BCORQ6W2J9 1755 aa20.19■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 SLC51AQ86UW1 340 aa20.19■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.19■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 ZNF790Q6PG37 636 aa20.18■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 PSMD1Q99460 953 aa20.17■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 PANK3Q9H999 370 aa20.17■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 SNED1Q8TER0 1413 aa20.17■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 ALDH1B1P30837 517 aa20.16■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.16■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.15■□□□□ 0.82
USP15-216ENST00000550632 KCNQ3O43525 872 aa20.14■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 TEFQ10587 303 aa20.13■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.13■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.12■□□□□ 0.81
USP15-216ENST00000550632 IL17REQ8NFR9 667 aa20.12■□□□□ 0.81
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