RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549358.5

TRAFD1-206, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene TRAFD1, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-206ENST00000549358 SOGA3Q5TF21 947 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 STYK1Q6J9G0 422 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 CNBD1Q8NA66 436 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 SETDB2Q96T68 719 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-206ENST00000549358 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 MASTLQ96GX5 879 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 MRC1P22897 1456 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ABCB7O75027 752 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ST5P78524 1137 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 CNTROBQ8N137 903 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 HACL1Q9UJ83 578 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 RASSF10A6NK89 507 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 A1BGP04217 495 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 EPHX2P34913 555 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 CCDC93Q567U6 631 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ZNF790Q6PG37 636 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 SLX4Q8IY92 1834 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 CAMTA2O94983 1202 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 TEFQ10587 303 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 OLFM4Q6UX06 510 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-206ENST00000549358 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 SCN4AP35499 1836 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 SCN7AQ01118 1682 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 NPR1P16066 1061 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 IL17REQ8NFR9 667 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 FZD9O00144 591 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 GRM1Q13255 1194 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 GPC2Q8N158 579 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 SYNE4Q8N205 404 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 CACNA1SQ13698 1873 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 RGS19P49795 217 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 CAPNS2Q96L46 248 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 FAM177BA6PVY3 158 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 KCNQ3O43525 872 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 JDP2Q8WYK2 163 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 USP16Q9Y5T5 823 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-206ENST00000549358 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 BTBD11A6QL63 1104 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 ALDH1B1P30837 517 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 ECE1P42892 770 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 CFAP44Q96MT7 982 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 TSKSQ9UJT2 592 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 CST9Q5W186 159 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAFD1-206ENST00000549358 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms