RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.18■■□□□ 1.78
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CTDSP2-204ENST00000548823 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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CTDSP2-204ENST00000548823 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC39A6Q13433 755 aa26.14■■□□□ 1.78
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CTDSP2-204ENST00000548823 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDSP2-204ENST00000548823 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP2-204ENST00000548823 CNKSR1Q969H4 720 aa26.13■■□□□ 1.77
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CTDSP2-204ENST00000548823 A0A087WZG4 1122 aa26.12■■□□□ 1.77
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CTDSP2-204ENST00000548823 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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CTDSP2-204ENST00000548823 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.09■■□□□ 1.77
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CTDSP2-204ENST00000548823 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.08■■□□□ 1.76
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CTDSP2-204ENST00000548823 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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CTDSP2-204ENST00000548823 SCN7AQ01118 1682 aa26.04■■□□□ 1.76
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CTDSP2-204ENST00000548823 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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CTDSP2-204ENST00000548823 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
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CTDSP2-204ENST00000548823 ECE1P42892 770 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDSP2-204ENST00000548823 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDSP2-204ENST00000548823 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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CTDSP2-204ENST00000548823 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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CTDSP2-204ENST00000548823 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CTDSP2-204ENST00000548823 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF790Q6PG37 636 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CTDSP2-204ENST00000548823 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDSP2-204ENST00000548823 BCORQ6W2J9 1755 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDSP2-204ENST00000548823 HMOX1P09601 288 aa25.88■■□□□ 1.73
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CTDSP2-204ENST00000548823 OLFM4Q6UX06 510 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.88■■□□□ 1.73
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