RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.47■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.46■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 RIC3Q7Z5B4 369 aa36.46■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 ITPRIPQ8IWB1 547 aa36.46■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 PLBD2Q8NHP8 589 aa36.45■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 EXOC6Q8TAG9 804 aa36.45■■■■□ 3.43
BRF1-213ENST00000548421 CCT4P50991 539 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.44■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 KIF6Q6ZMV9 814 aa36.43■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 ATP10DQ9P241 1426 aa36.43■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 DDX19BQ9UMR2 479 aa36.43■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 COL15A1P39059 1388 aa36.41■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 GNPATO15228 680 aa36.4■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 RPS6KA4O75676 772 aa36.4■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 AK7Q96M32 723 aa36.4■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 UBR3Q6ZT12 1888 aa36.4■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 BAG6P46379 1132 aa36.39■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 CCDC125Q86Z20 511 aa36.39■■■■□ 3.42
BRF1-213ENST00000548421 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 ARXQ96QS3 562 aa36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa36.38■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 A0A087WZG4 1122 aa36.37■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 BEND3Q5T5X7 828 aa36.37■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa36.37■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 BCORQ6W2J9 1755 aa36.36■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 NEXNQ0ZGT2 675 aa36.36■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 NUP98P52948 1817 aa36.35■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa36.35■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa36.34■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.33■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 LINS1Q8NG48 757 aa36.33■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 MYD88Q99836 296 aa36.33■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 C4AP0C0L4 1744 aa36.33■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 AAMPQ13685 434 aa36.32■■■■□ 3.41
BRF1-213ENST00000548421 SCN7AQ01118 1682 aa36.31■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 ALDH1L1O75891 902 aa36.31■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 ADRA2BP18089 450 aa36.29■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 CAMTA2O94983 1202 aa36.28■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 IGKV5-2P06315 115 aa36.28■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.28■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 AMIGO3Q86WK7 504 aa36.28■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 HLFQ16534 295 aa36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 TRAPPC3LQ5T215 181 aa36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 AKT1S1Q96B36 256 aa36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.27■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 SSFA2P28290 1259 aa36.26■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 TCIRG1Q13488 830 aa36.26■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa36.26■■■■□ 3.4
BRF1-213ENST00000548421 NEURL1BA8MQ27 555 aa36.25■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 PHF14O94880 888 aa36.25■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 SMIM5Q71RC9 77 aa36.25■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ZNF827Q17R98 1081 aa36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 NARFQ9UHQ1 456 aa36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 RGL2O15211 777 aa36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 MEIS3Q99687 375 aa36.24■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ZNF652Q9Y2D9 606 aa36.23■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.22■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 USP44Q9H0E7 712 aa36.22■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 PPP4R2Q9NY27 417 aa36.22■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 ZPR1O75312 459 aa36.21■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 GNAI3P08754 354 aa36.21■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 RFC4P35249 363 aa36.21■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.21■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 GCKRQ14397 625 aa36.2■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 CLEC4GQ6UXB4 293 aa36.2■■■■□ 3.39
BRF1-213ENST00000548421 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 CCDC191Q8NCU4 936 aa36.19■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 QSER1Q2KHR3 1735 aa36.18■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 GRM8O00222 908 aa36.17■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 USPL1Q5W0Q7 1092 aa36.17■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.16■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 UTYO14607 1347 aa36.15■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 FLAD1Q8NFF5 587 aa36.15■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 STK32BQ9NY57 414 aa36.15■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 GPTP24298 496 aa36.14■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
BRF1-213ENST00000548421 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
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