RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 PPP2R5AQ15172 486 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 TSG101Q99816 390 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 POTEJP0CG39 1038 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 PTGS1P23219 599 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 CNNM3Q8NE01 707 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 SMIM23A6NLE4 172 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 NDUFAB1O14561 156 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 HMOX1P09601 288 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 RLBP1P12271 317 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 VCX3BQ9H321 246 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 ARHGAP25P42331 645 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 ZBTB17Q13105 803 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 ZSCAN26Q16670 478 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 ERO1AQ96HE7 468 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC172P0C7W6 258 aa9.9□□□□□ -0.82
ATXN3-216ENST00000545170 UBASH3AP57075 661 aa9.9□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TUBB4AP04350 444 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 PSMC4P43686 418 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC38Q502W7 563 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TTC36A6NLP5 189 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MAP3K9P80192 1104 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GUCY1B3Q02153 619 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.89□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 EVCP57679 992 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 NEDD9Q14511 834 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TUBB4BP68371 445 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 FLIIQ13045 1269 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CNPY4Q8N129 248 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 VIMP08670 466 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 SYT1P21579 422 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CTNNA2P26232 953 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 IFT81Q8WYA0 676 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 WASF1Q92558 559 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MAP7Q14244 749 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 ELF2Q15723 593 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GGT6Q6P531 493 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.88□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MYO1BO43795 1136 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 KRT32Q14532 448 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 EVC2Q86UK5 1308 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GJB2P29033 226 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 SMIM24O75264 130 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 PSMD1Q99460 953 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 CETN3O15182 167 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MX1P20591 662 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 TERF1P54274 439 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.87□□□□□ -0.83
ATXN3-216ENST00000545170 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms