RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.77■■□□□ 1.4
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COPS7A-216ENST00000543170 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.77■■□□□ 1.4
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COPS7A-216ENST00000543170 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.76■■□□□ 1.39
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COPS7A-216ENST00000543170 COPS6Q7L5N1 327 aa23.71■■□□□ 1.39
COPS7A-216ENST00000543170 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.71■■□□□ 1.39
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COPS7A-216ENST00000543170 SETDB2Q96T68 719 aa23.71■■□□□ 1.39
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COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.69■■□□□ 1.38
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COPS7A-216ENST00000543170 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 VAMP4O75379 141 aa23.67■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 STK31Q9BXU1 1019 aa23.67■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.67■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.66■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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COPS7A-216ENST00000543170 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.66■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.65■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 CNBD1Q8NA66 436 aa23.65■■□□□ 1.38
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.64■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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COPS7A-216ENST00000543170 PARP10Q53GL7 1025 aa23.63■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.63■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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COPS7A-216ENST00000543170 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.61■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.61■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.61■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.61■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.61■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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COPS7A-216ENST00000543170 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.59■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 NPHP1O15259 732 aa23.59■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 SLC4A2P04920 1241 aa23.59■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF428Q96B54 188 aa23.59■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.59■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 DPEP1P16444 411 aa23.58■■□□□ 1.37
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COPS7A-216ENST00000543170 PDE6BP35913 854 aa23.58■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.58■■□□□ 1.37
COPS7A-216ENST00000543170 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.57■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 NTSR2O95665 410 aa23.57■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.57■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 A0A0G2JLW4 131 aa23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 KCNA3P22001 575 aa23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 FLIIQ13045 1269 aa23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 SUSD4Q5VX71 490 aa23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 ABCC12Q96J65 1359 aa23.55■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 KSR2Q6VAB6 950 aa23.55■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 NLRP10Q86W26 655 aa23.55■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 ADCY9O60503 1353 aa23.54■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 GPR162Q16538 588 aa23.54■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 G2E3Q7L622 706 aa23.54■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 FAM177BA6PVY3 158 aa23.53■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 CHRNA5P30532 468 aa23.53■■□□□ 1.36
COPS7A-216ENST00000543170 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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