RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SLC8A3P57103 927 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CUL4AQ13619 759 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PDIA5Q14554 519 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PTPN14Q15678 1187 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ELF2Q15723 593 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC27Q2M243 656 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC93Q567U6 631 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNHG1-211ENST00000539921 SARM1Q6SZW1 724 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 BRAPQ7Z569 592 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 WDR63Q8IWG1 891 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RNF214Q8ND24 703 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GCC1Q96CN9 775 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 BORCS6Q96GS4 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 BATF3Q9NR55 127 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNHG1-211ENST00000539921 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 COG6Q9Y2V7 657 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MAP3K5Q99683 1374 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CUL7Q14999 1698 aa7.19□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 POTEB2H3BUK9 544 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CHUKO15111 745 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC192P0DO97 292 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GPTP24298 496 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 INHBEP58166 350 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 UBE2HP62256 183 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TMX1Q9H3N1 280 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 IFT57Q9NWB7 429 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MCM8Q9UJA3 840 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.18□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MED14O60244 1454 aa7.17□□□□□ -1.26
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SNHG1-211ENST00000539921 CCDC151A5D8V7 595 aa7.17□□□□□ -1.26
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SNHG1-211ENST00000539921 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 IMPDH2P12268 514 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GSDMDP57764 484 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SLMAPQ14BN4 828 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 BRD3Q15059 726 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PLCB4Q15147 1175 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 WLSQ5T9L3 541 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1328Q86T90 577 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 NBPF15Q8N660 670 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 IL16Q14005 1332 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 DAPK1P53355 1430 aa7.17□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 NESP48681 1621 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 H7C1W4 665 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MAP2K7O14733 419 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 KINO60870 393 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RTN2O75298 545 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 ERLIN2O94905 339 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TBC1D8O95759 1140 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 MNAT1P51948 309 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 TMED1Q13445 227 aa7.16□□□□□ -1.26
SNHG1-211ENST00000539921 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.16□□□□□ -1.26
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