RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.68■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKAR2BP31323 418 aa25.67■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABHD8Q96I13 439 aa25.67■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPHP1O15259 732 aa25.66■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.66■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM161AQ3B820 660 aa25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCN4AP35499 1836 aa25.65■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRGNP10124 158 aa25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNBD1Q8NA66 436 aa25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 MASTLQ96GX5 879 aa25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETDB2Q96T68 719 aa25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.64■■□□□ 1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 RASSF10A6NK89 507 aa25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST5P78524 1137 aa25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 HACL1Q9UJ83 578 aa25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.63■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.62■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.62■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 RALBP1Q15311 655 aa25.61■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.61■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC93Q567U6 631 aa25.6■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.59■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPHX2P34913 555 aa25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNTROBQ8N137 903 aa25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 IL17REQ8NFR9 667 aa25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLX4Q8IY92 1834 aa25.58■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGS19P49795 217 aa25.55■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.55■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF790Q6PG37 636 aa25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCN7AQ01118 1682 aa25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAMTA2O94983 1202 aa25.53■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPR1P16066 1061 aa25.53■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.52■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEFQ10587 303 aa25.52■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.52■■□□□ 1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 ECE1P42892 770 aa25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPC2Q8N158 579 aa25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.51■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 FZD9O00144 591 aa25.5■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.5■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.5■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.49■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.49■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCM10Q7L590 875 aa25.49■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 A1BGP04217 495 aa25.48■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCTN1Q14203 1278 aa25.48■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.48■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.48■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.47■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNA1SQ13698 1873 aa25.47■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH1B1P30837 517 aa25.46■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 JDP2Q8WYK2 163 aa25.46■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAPNS2Q96L46 248 aa25.46■■□□□ 1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEFMP07197 916 aa25.44■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNE4Q8N205 404 aa25.44■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNQ3O43525 872 aa25.43■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTBD11A6QL63 1104 aa25.42■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGL2O15211 777 aa25.42■■□□□ 1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
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