RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FDX1P10109 184 aa7.5□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.5□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRICD5Q6PL45 260 aa7.5□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACEP12821 1306 aa7.5□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S1PR4O95977 384 aa7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXC1Q12948 553 aa7.49□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRS2Q9HD23 443 aa7.49□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF1AQ12756 1690 aa7.49□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFV2P19404 249 aa7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSME1Q06323 249 aa7.49□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP13Q86W25 1043 aa7.49□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.49□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COG3Q96JB2 828 aa7.48□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GJA5P36382 358 aa7.47□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.47□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP53Q96M91 514 aa7.47□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.47□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSS51Q4VC12 460 aa7.47□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP4X1Q8N118 509 aa7.47□□□□□ -1.21
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.46□□□□□ -1.21
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.46□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FYB1O15117 783 aa7.46□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPTLC1O15269 473 aa7.46□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP2R1AP30153 589 aa7.46□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.46□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.46□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RETREG3Q86VR2 466 aa7.45□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.45□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABTB2Q8N961 1025 aa7.44□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGD1P98174 961 aa7.44□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTMR2Q13614 643 aa7.44□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NME9Q86XW9 330 aa7.44□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.44□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.43□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.43□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUDCQ9Y266 331 aa7.43□□□□□ -1.22
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GMPRP36959 345 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.42□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOM1O60784 492 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTHFSP49914 203 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP16P51512 607 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF428Q96B54 188 aa7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.41□□□□□ -1.22
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