RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529957.5

GNPTG-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-208	ENST00000529957	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	HTRA3	P83110	453 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	GLTPD2	A6NH11	291 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	SRGN	P10124	158 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
GNPTG-208	ENST00000529957	ST5	P78524	1137 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	NPHP1	O15259	732 aa		29.25	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	FSTL1	Q12841	308 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	HLF	Q16534	295 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	STYK1	Q6J9G0	422 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	CNKSR1	Q969H4	720 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	MASTL	Q96GX5	879 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	29.22	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	NUP98	P52948	1817 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	POTEC	B2RU33	542 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.21	■■■□□ 2.27
GNPTG-208	ENST00000529957	FAM177B	A6PVY3	158 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	NEFM	P07197	916 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	ERFE	Q4G0M1	354 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		29.18	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	RGL2	O15211	777 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	IFFO2	Q5TF58	517 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	OLFM4	Q6UX06	510 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		29.14	■■■□□ 2.26
GNPTG-208	ENST00000529957	NPR1	P16066	1061 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	KLRG1	Q96E93	195 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	PCNT	O95613	3336 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	ABCC12	Q96J65	1359 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	MYL6B	P14649	208 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	SOGA3	Q5TF21	947 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC93	Q567U6	631 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	RIPK4	P57078	832 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	RALBP1	Q15311	655 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	GPT	P24298	496 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	POTEI	P0CG38	1075 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	POTEJ	P0CG39	1038 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	JMY	Q8N9B5	988 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	PDIA6	Q15084	440 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	CRY2	Q49AN0	593 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	SUSD4	Q5VX71	490 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	SNED1	Q8TER0	1413 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GNPTG-208	ENST00000529957	PROSER3	Q2NL68	480 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	SLC51A	Q86UW1	340 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	NYX	Q9GZU5	481 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	SCN4A	P35499	1836 aa		29	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	ANXA1	P04083	346 aa		29	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	ALDH1B1	P30837	517 aa		29	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		28.98	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	NTSR2	O95665	410 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.97	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	COL4A5	P29400	1685 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
GNPTG-208	ENST00000529957	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		28.95	■■■□□ 2.23

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