RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 NUDCQ9Y266 331 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 SCN7AQ01118 1682 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 CHADLQ6NUI6 762 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 TNS4Q8IZW8 715 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 MCM10Q7L590 875 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-210ENST00000527027 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 RGL2O15211 777 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 NPR1P16066 1061 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF26B4DH59 902 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 POTEIP0CG38 1075 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 POTEJP0CG39 1038 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC93Q567U6 631 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF15Q8N660 670 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 CREBZFQ9NS37 354 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 SLX4Q8IY92 1834 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 PPP2R1AP30153 589 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 DCTN1Q14203 1278 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 CAPN15O75808 1086 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-210ENST00000527027 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 BCORQ6W2J9 1755 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 FAM177BA6PVY3 158 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 ALDH1B1P30837 517 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 LDHDQ86WU2 507 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRU-210ENST00000527027 PASKQ96RG2 1323 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-210ENST00000527027 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRU-210ENST00000527027 SYNE4Q8N205 404 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 HACL1Q9UJ83 578 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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PTPRU-210ENST00000527027 CNTNAP1P78357 1384 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 FZD9O00144 591 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 NEFMP07197 916 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 CRY2Q49AN0 593 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRU-210ENST00000527027 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 PSMD1Q99460 953 aa21.36■■□□□ 1.01
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PTPRU-210ENST00000527027 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 GPC2Q8N158 579 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 JDP2Q8WYK2 163 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 FOXN1O15353 648 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 VEGFBP49765 207 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-210ENST00000527027 ABCC12Q96J65 1359 aa21.33■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 CNTROBQ8N137 903 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 MYL6BP14649 208 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRU-210ENST00000527027 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.31■■□□□ 1
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