RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC30A3Q99726 388 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-904P-201ENST00000516206 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGLV1-40P01703 118 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF124Q15973 351 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 AP1G2O75843 785 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 TATP17735 454 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 GRIK1P39086 918 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 NBPF1Q3BBV0 1214 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 SAMD5Q5TGI4 173 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 DTX1Q86Y01 620 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ABI1Q8IZP0 508 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ASIC4Q96FT7 647 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 NCANO14594 1321 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 DBX1A6NMT0 343 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZBBXA8MT70 800 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRRG2O14669 202 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 GSC2O15499 205 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 SPEM2Q0P670 501 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 BICDL1Q6ZP65 573 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ETNK1Q9HBU6 452 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ALX3O95076 343 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 FBXO45P0C2W1 286 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 NEUROD1Q13562 356 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 FBXO11Q86XK2 927 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 SOCS7O14512 581 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 BARGINQ6ZT62 677 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGFLR1Q9H665 355 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 AKTIPQ9H8T0 292 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC6A14Q9UN76 642 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAXQ9Y2V3 346 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 B8ZZF3 427 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 LILRA6Q6PI73 481 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 ILDR2Q71H61 639 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 STOML1Q9UBI4 398 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRIM66O15016 1216 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 USP17L8P0C7I0 530 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 BHMTQ93088 406 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRR19A6NJB7 356 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 ITGB5P18084 799 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFIAQ12857 509 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 MSL1Q68DK7 614 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSPH6AQ9H0K4 717 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 NAGPAQ9UK23 515 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 PARP3Q9Y6F1 533 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 GLB1P16278 677 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 TXLNAP40222 546 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 SMTNP53814 917 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 PKN1Q16512 942 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 CBLL1Q75N03 491 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRIM34Q9BYJ4 488 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 NEUROD4Q9HD90 331 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 CABP1Q9NZU7 370 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 JAG2Q9Y219 1238 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 USP3Q9Y6I4 520 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 F8W735 103 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DLL1O00548 723 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DHX15O43143 795 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZMYND10O75800 440 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 INHAP05111 366 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 SCNN1DP51172 638 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 GDF10P55107 478 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 WFDC8Q8IUA0 241 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRIM42Q8IWZ5 723 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 HMX2A2RU54 273 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-904P-201ENST00000516206 NR1H3Q13133 447 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms