RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CABP1	Q9NZU7	370 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	STK26	Q9P289	416 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	OFD1	O75665	1012 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SULF1	Q8IWU6	871 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	TERF1	P54274	439 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	NUCB2	P80303	420 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA0232	Q92628	1395 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	IL17RA	Q96F46	866 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RTL1	A6NKG5	1358 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RAPGEF3	O95398	923 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	FBLN1	P23142	703 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP85	Q6P2H3	762 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RICTOR	Q6R327	1708 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CPS1	P31327	1500 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CHL1	O00533	1208 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	HMOX1	P09601	288 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CD46	P15529	392 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SDS	P20132	328 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	NME9	Q86XW9	330 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SLF2	Q8IX21	1173 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RDH13	Q8NBN7	331 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	GPT2	Q8TD30	523 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	TECPR2	O15040	1411 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CRB1	P82279	1406 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF40	O75150	1001 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC10A3	P09131	477 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	MCM5	P33992	734 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	PKP1	Q13835	747 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	WNT2B	Q93097	391 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	SIRT1	Q96EB6	747 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	LRCH3	Q96II8	777 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRC	P08575	1304 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	CUL4A	Q13619	759 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT24	Q2M2I5	525 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	MSH6	P52701	1360 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	ERC2	O15083	957 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	REC8	O95072	547 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	BRD1	O95696	1058 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	GCGR	P47871	477 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ATXN3-212	ENST00000515746	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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