RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512731.5

MMP23B-210, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 1,531 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-210ENST00000512731 CLEC4GQ6UXB4 293 aa32.87■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.87■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 DDR1Q08345 913 aa32.86■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 NFIXQ14938 502 aa32.86■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 HYPKQ9NX55 129 aa32.86■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.86■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.85■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 VAMP4O75379 141 aa32.85■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.84■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 COPS6Q7L5N1 327 aa32.84■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.84■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 PARP3Q9Y6F1 533 aa32.84■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.85
MMP23B-210ENST00000512731 ZBED9Q6R2W3 1325 aa32.82■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 HLFQ16534 295 aa32.82■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.82■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.81■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 NUP98P52948 1817 aa32.8■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.8■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 STK31Q9BXU1 1019 aa32.8■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 ATP10DQ9P241 1426 aa32.79■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.79■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 C10orf71Q711Q0 1435 aa32.79■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 SETDB2Q96T68 719 aa32.77■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 SYT17Q9BSW7 474 aa32.77■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 KIF13BQ9NQT8 1826 aa32.76■■■□□ 2.84
MMP23B-210ENST00000512731 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 KLHL34Q8N239 644 aa32.76■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 SERPINB2P05120 415 aa32.75■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 CD2APQ9Y5K6 639 aa32.75■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.74■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.74■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 CACNA1FO60840 1977 aa32.74■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.72■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 SLC4A2P04920 1241 aa32.72■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.72■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.72■■■□□ 2.83
MMP23B-210ENST00000512731 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.69■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.69■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.69■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 NLGN2Q8NFZ4 835 aa32.68■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF428Q96B54 188 aa32.68■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 G2E3Q7L622 706 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 DDX58O95786 925 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 GPTP24298 496 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 FLIIQ13045 1269 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 CNBD1Q8NA66 436 aa32.67■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 TCIRG1Q13488 830 aa32.66■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.65■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 PXDNLA1KZ92 1463 aa32.64■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 PARP10Q53GL7 1025 aa32.64■■■□□ 2.82
MMP23B-210ENST00000512731 TGFB2P61812 414 aa32.62■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 ADCY9O60503 1353 aa32.62■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.61■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 NPHP1O15259 732 aa32.61■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 KSR2Q6VAB6 950 aa32.61■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 NYXQ9GZU5 481 aa32.61■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 PI4KAP2A4QPH2 592 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 FAM177BA6PVY3 158 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 ST5P78524 1137 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 ALDH1L2Q3SY69 923 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 SUSD4Q5VX71 490 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 ISCA1Q9BUE6 129 aa32.6■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 NLRP10Q86W26 655 aa32.59■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa32.59■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 NTSR2O95665 410 aa32.58■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.58■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
MMP23B-210ENST00000512731 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.57■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.57■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 RNF123Q5XPI4 1314 aa32.56■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa32.56■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 MYD88Q99836 296 aa32.55■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 BCL2L13Q9BXK5 485 aa32.55■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 ABCC12Q96J65 1359 aa32.55■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.54■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.54■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.53■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 DPEP1P16444 411 aa32.53■■■□□ 2.8
MMP23B-210ENST00000512731 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms