RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 SNX21Q969T3 373 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NBPF15Q8N660 670 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 EXOC4Q96A65 974 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PICK1Q9NRD5 415 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 ITM2BQ9Y287 266 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 WIZO95785 1651 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 RTN2O75298 545 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 HMMRO75330 724 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TPPPO94811 219 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 KCNA2P16389 499 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 SOGA3Q5TF21 947 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC31Q6UY01 552 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MORC4Q8TE76 937 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 CRBNQ96SW2 442 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 NACA2Q9H009 215 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-216ENST00000507116 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 H7C1W4 665 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KRT38O76015 456 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC80Q76M96 950 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 GTF3C6Q969F1 213 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 DDX11Q96FC9 970 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FAM81BQ96LP2 452 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM165Q9HC07 324 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ROCK1Q13464 1354 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ABL2P42684 1182 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 IQCB1Q15051 598 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA32Q96LK8 384 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 USP25Q9UHP3 1055 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CBFA2T2O43439 604 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 E2F6O75461 281 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ZBED6P86452 979 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SNX1Q13596 522 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 NEK9Q8TD19 979 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CREB3O43889 395 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RPS6KA5O75582 802 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 LAMB3Q13751 1172 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SLC27A2O14975 620 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ERLIN1O75477 346 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CYP11B2P19099 503 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RANBP1P43487 201 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ST5P78524 1137 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 PDE3BQ13370 1112 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SMC5Q8IY18 1101 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SAAL1Q96ER3 474 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM11Q96F44 468 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MYO1BO43795 1136 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 SEC24BO95487 1268 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 GPTP24298 496 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MECOMQ03112 1051 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-216ENST00000507116 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms