RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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SMIM20-201ENST00000506197 GRIN3BO60391 1043 aa25.67■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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SMIM20-201ENST00000506197 NBPF15Q8N660 670 aa25.66■■□□□ 1.7
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SMIM20-201ENST00000506197 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.63■■□□□ 1.69
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SMIM20-201ENST00000506197 NUP98P52948 1817 aa25.54■■□□□ 1.68
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SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.51■■□□□ 1.67
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SMIM20-201ENST00000506197 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.5■■□□□ 1.67
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SMIM20-201ENST00000506197 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.48■■□□□ 1.67
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SMIM20-201ENST00000506197 TM4SF1P30408 202 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 RGL2O15211 777 aa25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.44■■□□□ 1.66
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