RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 HYPKQ9NX55 129 aa25.68■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 GRIN3BO60391 1043 aa25.67■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF26B4DH59 902 aa25.66■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 ANXA1P04083 346 aa25.66■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.66■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 NBPF15Q8N660 670 aa25.66■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 GYS1P13807 737 aa25.65■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 PDIA6Q15084 440 aa25.65■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 PROSER3Q2NL68 480 aa25.65■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SMIM20-201ENST00000506197 KIF16BQ96L93 1317 aa25.63■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 BCAR3O75815 825 aa25.63■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.63■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.62■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 COL15A1P39059 1388 aa25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 FLIIQ13045 1269 aa25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.6■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 A0A087WZG4 1122 aa25.59■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 G2E3Q7L622 706 aa25.59■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.59■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 COPS6Q7L5N1 327 aa25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.58■■□□□ 1.69
SMIM20-201ENST00000506197 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.57■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 PTPRCP08575 1304 aa25.57■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 BCORQ6W2J9 1755 aa25.56■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 NUP98P52948 1817 aa25.54■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 FKBP8Q14318 412 aa25.54■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.54■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.54■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 SCN7AQ01118 1682 aa25.54■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 ZPR1O75312 459 aa25.53■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 TGFB2P61812 414 aa25.53■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.53■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.52■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.52■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.52■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.52■■□□□ 1.68
SMIM20-201ENST00000506197 DDR1Q08345 913 aa25.51■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.51■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.51■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.51■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.51■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 KSR2Q6VAB6 950 aa25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0G2JLW4 131 aa25.49■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 NARFQ9UHQ1 456 aa25.49■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.49■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ADCY9O60503 1353 aa25.48■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.48■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 MS4A1P11836 297 aa25.48■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.48■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 PLIN1O60240 522 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 CAMTA2O94983 1202 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 TRIM27P14373 513 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 DPEP1P16444 411 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.47■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 ATP10DQ9P241 1426 aa25.46■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 F6X3S4 739 aa25.46■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 BCS1LQ9Y276 419 aa25.46■■□□□ 1.67
SMIM20-201ENST00000506197 TM4SF1P30408 202 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.45■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 RGL2O15211 777 aa25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SMIM20-201ENST00000506197 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms