RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 AK9Q5TCS8 1911 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 DDB1Q16531 1140 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 DISP2A7MBM2 1401 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC5O00471 708 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 PDE1AP54750 535 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 MTX1Q13505 466 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 LINS1Q8NG48 757 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 NBR1Q14596 966 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ITGB4P16144 1822 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 UTYO14607 1347 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 RAB11FIP3O75154 756 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 SDSP20132 328 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 USP16Q9Y5T5 823 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 SRGAP3O43295 1099 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 BCL11AQ9H165 835 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ERBB4Q15303 1308 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 MYL6BP14649 208 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 MX1P20591 662 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 COPS6Q7L5N1 327 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 STAP2Q9UGK3 403 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 TNS2Q63HR2 1409 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 AOX1Q06278 1338 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 GRM8O00222 908 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 FAM182BQ5T319 152 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV5-2P06315 115 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 CASC1Q6TDU7 716 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 KIF2CQ99661 725 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 SNX21Q969T3 373 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 ILDR2Q71H61 639 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 KAZALD1Q96I82 304 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 SUCLG2Q96I99 432 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 GCKRQ14397 625 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 MYD88Q99836 296 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 HSCBQ8IWL3 235 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 USP26Q9BXU7 913 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 TJP1Q07157 1748 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NFKBIBQ15653 356 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 COL15A1P39059 1388 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF26B4DH59 902 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF14Q5TI25 921 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF15Q8N660 670 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 ERC2O15083 957 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 REC8O95072 547 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 SBF2Q86WG5 1849 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 DOT1LQ8TEK3 1739 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 CHMLP26374 656 aa10.02□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.02□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 RILPL2Q969X0 211 aa10.02□□□□□ -0.8
PDE4D-208ENST00000502484 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 177.1 ms