RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 C12orf49Q9H741 205 aa6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC6O75061 913 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TBCELQ5QJ74 424 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 POTEAQ6S8J7 498 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.76□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SNPHO15079 494 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ZAP70P43403 619 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 MTFR1Q15390 333 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SPC25Q9HBM1 224 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 A6NJY4 79 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 GIPC1O14908 333 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 NEFLP07196 543 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.74□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ADH1BP00325 375 aa6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.73□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TK2O00142 265 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 TLL1O43897 1013 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 PCSK2P16519 638 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 SMTNP53814 917 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 GORABQ5T7V8 394 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 COPRSQ9NQ92 184 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADB-210ENST00000498648 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 BCAMP50895 628 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 DGKZQ13574 1117 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 RASA3Q14644 834 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 TMX1Q9H3N1 280 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 SNTG2Q9NY99 539 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 EML1O00423 815 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 KLF4O43474 513 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 GNRH1P01148 92 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 USP17L7P0C7H9 530 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 COPS2P61201 443 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 SH3BP2P78314 561 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 RAB33AQ14088 237 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 RTN1Q16799 776 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 PI16Q6UXB8 463 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 NGLY1Q96IV0 654 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 USP3Q9Y6I4 520 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 ETFBP38117 255 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 WNT7BP56706 349 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 AMPD3Q01432 767 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.69□□□□□ -1.34
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