RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.37■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 NBPF15Q8N660 670 aa34.37■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 WDR90Q96KV7 1748 aa34.37■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 NPHP1O15259 732 aa34.35■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 NEFMP07197 916 aa34.35■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.35■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.34■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 SLX4Q8IY92 1834 aa34.34■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 C21orf2O43822 256 aa34.33■■■■□ 3.09
CUL4A-211ENST00000498562 GLTPD2A6NH11 291 aa34.31■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 RGL2O15211 777 aa34.31■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 SRGNP10124 158 aa34.31■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 FSTL1Q12841 308 aa34.31■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 NFE2L2Q16236 605 aa34.3■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 STYK1Q6J9G0 422 aa34.3■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 CNKSR1Q969H4 720 aa34.29■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 MASTLQ96GX5 879 aa34.28■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.26■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
CUL4A-211ENST00000498562 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.26■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa34.25■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 HLFQ16534 295 aa34.24■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.23■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 NUP98P52948 1817 aa34.22■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 ERFEQ4G0M1 354 aa34.21■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.21■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 SMC1BQ8NDV3 1235 aa34.21■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 SOGA3Q5TF21 947 aa34.2■■■■□ 3.07
CUL4A-211ENST00000498562 FAM177BA6PVY3 158 aa34.18■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 NPR1P16066 1061 aa34.18■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 HTRA3P83110 453 aa34.18■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 RALBP1Q15311 655 aa34.18■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 POTECB2RU33 542 aa34.17■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.17■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 C7orf43Q8WVR3 580 aa34.17■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 NGEFQ8N5V2 710 aa34.16■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.15■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 ERVV-1B6SEH8 477 aa34.15■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 TTLL7Q6ZT98 887 aa34.14■■■■□ 3.06
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC93Q567U6 631 aa34.13■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 ABCC12Q96J65 1359 aa34.12■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 MYL6BP14649 208 aa34.11■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 IFFO2Q5TF58 517 aa34.11■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 KIF6Q6ZMV9 814 aa34.11■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 KLRG1Q96E93 195 aa34.11■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 RIPK4P57078 832 aa34.1■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 TSPYL4Q9UJ04 414 aa34.1■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 ERBB4Q15303 1308 aa34.09■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 NYXQ9GZU5 481 aa34.09■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.07■■■■□ 3.05
CUL4A-211ENST00000498562 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.07■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 OLFM4Q6UX06 510 aa34.07■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.07■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.07■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 CRY2Q49AN0 593 aa34.06■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 ALDH1B1P30837 517 aa34.05■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 TMPOP42166 694 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 SNED1Q8TER0 1413 aa34.04■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 GPTP24298 496 aa34.04■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 LRP10Q7Z4F1 713 aa34.04■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 JMYQ8N9B5 988 aa34.03■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 BABAM1Q9NWV8 329 aa34.03■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 LMOD3Q0VAK6 560 aa34.02■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.02■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.02■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CUL4A-211ENST00000498562 PDIA6Q15084 440 aa34.01■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 SUSD4Q5VX71 490 aa34.01■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 SCN4AP35499 1836 aa34.01■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 NTSR2O95665 410 aa33.99■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa33.98■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 PROSER3Q2NL68 480 aa33.97■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.97■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF541Q9H0D2 1346 aa33.97■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 POTEIP0CG38 1075 aa33.96■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 POTEJP0CG39 1038 aa33.96■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 ANXA1P04083 346 aa33.95■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CUL4A-211ENST00000498562 SYNE4Q8N205 404 aa33.95■■■■□ 3.03
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