RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TIMM17B-208ENST00000495490 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TIMM17B-208ENST00000495490 TEFQ10587 303 aa21.9■■□□□ 1.1
TIMM17B-208ENST00000495490 SOGA3Q5TF21 947 aa21.9■■□□□ 1.1
TIMM17B-208ENST00000495490 MASTLQ96GX5 879 aa21.9■■□□□ 1.1
TIMM17B-208ENST00000495490 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.89■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 LDHDQ86WU2 507 aa21.89■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 ST5P78524 1137 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.87■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 NPHP1O15259 732 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 KCNQ3O43525 872 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 VEGFBP49765 207 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC93Q567U6 631 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 USP16Q9Y5T5 823 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM17B-208ENST00000495490 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 WBP1LQ9NX94 342 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 BTBD11A6QL63 1104 aa21.81■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 NPR1P16066 1061 aa21.81■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 OLFM4Q6UX06 510 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 AIDAQ96BJ3 306 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 HACL1Q9UJ83 578 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 EPHX2P34913 555 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 SNED1Q8TER0 1413 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 RASSF10A6NK89 507 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 FZD9O00144 591 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 RGL2O15211 777 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.77■■□□□ 1.08
TIMM17B-208ENST00000495490 LBX1P52954 281 aa21.76■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.76■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.76■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF26B4DH59 902 aa21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 CNTROBQ8N137 903 aa21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF15Q8N660 670 aa21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.75■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 PRKAR2BP31323 418 aa21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.74■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 GPC2Q8N158 579 aa21.73■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 SYNE4Q8N205 404 aa21.73■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 COL4A5P29400 1685 aa21.72■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 LTBP1Q14766 1721 aa21.72■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 NUP98P52948 1817 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 ALDH1B1P30837 517 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 PSMD1Q99460 953 aa21.71■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TIMM17B-208ENST00000495490 HLFQ16534 295 aa21.7■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 CRY2Q49AN0 593 aa21.7■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.69■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 FAM177BA6PVY3 158 aa21.69■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 MCM10Q7L590 875 aa21.69■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.69■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 ABHD8Q96I13 439 aa21.68■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCC12Q96J65 1359 aa21.67■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 JDP2Q8WYK2 163 aa21.66■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC34A2O95436 690 aa21.65■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 SCNN1DP51172 638 aa21.65■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.65■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TIMM17B-208ENST00000495490 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TIMM17B-208ENST00000495490 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
TIMM17B-208ENST00000495490 DCTN1Q14203 1278 aa21.64■■□□□ 1.05
TIMM17B-208ENST00000495490 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms