RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491075.1

CLIP2-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene CLIP2, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP2-208	ENST00000491075	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CLIP2-208	ENST00000491075	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	SRGN	P10124	158 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	CAPN15	O75808	1086 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	SCN4A	P35499	1836 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CLIP2-208	ENST00000491075	KCNQ3	O43525	872 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	CFAP53	Q96M91	514 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	RGL2	O15211	777 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	NPR1	P16066	1061 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CLIP2-208	ENST00000491075	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	NUDC	Q9Y266	331 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.6	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	MCM10	Q7L590	875 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CLIP2-208	ENST00000491075	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.57	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.56	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.55	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.55	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.54	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.53	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	NUP98	P52948	1817 aa		27.53	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.52	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
CLIP2-208	ENST00000491075	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	FOXN1	O15353	648 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	OLFM4	Q6UX06	510 aa		27.51	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	EPHX2	P34913	555 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	FZD9	O00144	591 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	HLF	Q16534	295 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.49	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.48	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	VEGFB	P49765	207 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	GPC2	Q8N158	579 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	SYNE4	Q8N205	404 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	PSMD1	Q99460	953 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CLIP2-208	ENST00000491075	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.45	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.45	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.44	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.43	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.42	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.42	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
CLIP2-208	ENST00000491075	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.42	■■□□□ 1.98

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